Super Mario Sunshine bygger videre på den formel der gjorde
Super Mario 64 til et af de mest roste platformspil nogensinde. Da Mario, Prinsesse Peach og hendes hof ankommer til ferieøen Isle Delfino bliver øen pludselig vandaliseret af en mystisk forbryder med overskæg, kasket og stor næse. Mario anholdes, findes skyldig og idømmes samfundstjeneste - han skal gøre øen ren igen. Bevæbnet med FLUDD, en intelligent vandpistol, skal Mario rengøre ti enorme baner, samtidig med at gamle og nye fjender forsøger at gøre livet endnu mere surt for ham.